腐败、道路不畅、港口费用昂贵，是导致尼日利亚港口相比邻近西非各港口缺乏竞争力的主要原因。2016年尼反腐报告中，认为腐败与港口的低效率密切相关，使尼每年损失约1万亿奈拉。

腐败使尼日利亚港口成为世界上最昂贵的港口。为此，尼总统反腐败咨询委员会将在港口设立办事处，并将在2017年管理中采取强有力的反腐败措施，以减少港口欺诈和犯罪活动。尼港务局(NPA)正在研究西非各港口的各种关税，以确定尼港口与邻国间的竞争程度，建议联邦政府减少港口费用，使更多的船只和货物进入港口。专家相信，如果这些问题得到解决，尼将成为西非海上枢纽。